《苹果核战记》系列作品在04年、07年两次被改编成CG动画电影，但这次的新作拒绝炒冷饭，绝非原来作品的续集，而是进行了全新的故事创作。在剧情上，新作以生化克隆人建立的人工城市“奥林匹斯”作为舞台，以特种部队ES.W.A.T.的战士迪娜及其伙伴布里亚莱奥斯作为主角，讲述了两人卷入了将人类未来交由“生化人”的恐怖主义阴谋事件，并与之展开了对峙的故事。

本片导演是曾经执导《图书馆战争》的浜名孝行，脚本与设定由制作过《攻壳机动队》系列作品的Production I.G的工作人员加入参与。本作迪娜的声优将由坂本真绫担当，布里亚莱奥斯的声优则将由山寺宏一担任。

本片的发行模式和动漫「机动战士高达独角兽」相似，采用了电影院上映，网络放送和BD销售，唯一不同就是「苹果核战记XIII」的网络放送并不是走SONY PS3平台。2011年6月13日在东京和大阪的电影院里放送前半部的内容，2011年6月27日则在名古屋上映。在电影院上映的时候，限量版蓝光第一卷，普通版则在七月六日发售，第一卷的内容包含十三集内容中前三集。而后半部分的内容在2011年10月24日则在东京大阪上映，2011年11月7日在名古屋。而所用的13集的内容都将在网上配信。坂本真绫、山寺宏一将担任主役。在第五次世界大战后，围绕著迪娜及布里亚莱奥斯在「OLYMPUS」的故事而展开。